Docteur junior de médecine générale : de la rémunération annoncée au net mensuel

Un statut nouveau : docteur junior en quatrième année de médecine générale

Le docteur junior est un étudiant en troisième cycle qui a validé ses phases de socle et d'approfondissement et exerce en autonomie supervisée avant d'être thésé et inscrit à l'Ordre. Pour la médecine générale, le diplôme passe de trois à quatre ans : la quatrième année est organisée en deux stages de six mois, chacun de vingt-quatre semaines, soit environ douze mois de pratique supervisée.

Les textes réglementaires de cette année ont été publiés au Journal officiel du 28 août 2025 (un décret et deux arrêtés du 27 août 2025), puis complétés le 14 mai 2026 pour l'indemnisation des gardes de permanence des soins ambulatoires. Une instruction nationale publiée au bulletin officiel du 28 mai 2026 les rend applicables à partir du 2 novembre 2026.

Cette page traite le cas du docteur junior de médecine générale. Les autres spécialités ont leurs propres textes de rémunération, qui ne sont pas chiffrés ici.

Ce que le simulateur calcule, et pourquoi il ne s'applique pas tel quel

Le simulateur du haut de page applique les cotisations d'un salarié du privé non-cadre : vieillesse, retraite complémentaire Agirc-Arrco, CSG, CRDS et prélèvement à la source. Un docteur junior est un agent public hospitalier : son employeur est un établissement de santé, souvent un centre hospitalier universitaire, et ses cotisations de retraite ne sont pas celles du secteur privé. Le taux de la retraite complémentaire des agents contractuels de la fonction publique n'a pas pu être vérifié pour cette page et n'est donc pas chiffré.

Les montants nets donnés plus bas sont des repères de comparaison : ils indiquent à quel salaire du secteur privé correspond la rémunération annoncée, et non la somme exacte qui apparaîtra sur le bulletin. La fiche de paie de l'établissement reste la référence.

Les éléments de rémunération annoncés

Selon le support de présentation d'un département universitaire de médecine générale, daté de juin 2026, la rémunération se compose de la façon suivante :

La prime d'activité de 500 € brut par semestre n'est versée que si le docteur junior réalise en moyenne 200 actes ou consultations par mois. L'indemnité de 1 000 € par mois de stage concerne les stages situés en zone d'intervention prioritaire ; elle ne se cumule pas avec les indemnités de transport et d'hébergement. Des indemnités de logement et de transport restent possibles selon le même modèle que pour les phases précédentes.

Ces montants proviennent d'un support universitaire et d'une page de la Fédération hospitalière de France résumant les arrêtés. Ils sont à confirmer dans les textes officiels avant toute décision de stage.

Les gardes de permanence des soins ambulatoires

Les gardes sont volontaires, avec l'accord du maître de stage, et sont payées en sus. L'arrêté du 13 mai 2026 fixe, d'après la fédération hospitalière :

• 422,03 € brut pour une garde de douze heures, de 20 h à 8 h tous les jours et de 8 h à 20 h les dimanches et jours fériés ;
• 211,01 € brut pour une garde de début de soirée jusqu'à minuit ou pour un samedi de 12 h à 20 h ;
• 50 € brut de l'heure pour la régulation médicale.

Un repos de onze heures est exigé après une garde de nuit ou de soirée. Une garde de nuit par mois ajoute donc 422,03 € brut, soit environ 18 % de la rémunération mensuelle fixe, sans que le temps de travail réel suive la même proportion : la contrepartie est la fatigue et l'obligation de repos qui limite l'activité du lendemain.

Trois mois types chiffrés

On additionne les éléments mensuels et on passe le total dans le simulateur (statut non-cadre, taux neutre 2026) pour obtenir un net de comparaison.

Ces chiffres supposent un traitement de l'indemnité de stage comme un salaire ordinaire, ce qui est une hypothèse de comparaison : le régime social et fiscal réel des indemnités n'a pas été vérifié. En moyenne annuelle, le fixe et la prime d'autonomie représentent 33 495 € brut, soit 2 791 € par mois, avant primes d'activité et gardes.

Du brut au net : lire les écarts avec le secteur privé

Dans le privé, un non-cadre à 2 374,58 € brut touche 1 879,71 € avant impôt, soit 79,2 % du brut. Pour un agent public contractuel, le rapport peut différer, parce que la retraite de base et complémentaire relève d'autres régimes et que certaines indemnités suivent leurs propres règles. L'écart n'a pas pu être chiffré pour cette page.

Pour apprécier le niveau de vie, il vaut mieux comparer le net à payer avec ses charges : loyer, transport, assurance. Un docteur junior en stage ambulatoire dans une zone sous-dotée perçoit un complément de 1 000 € par mois, ce qui change l'équation par rapport à un stage hospitalier en ville universitaire, mais impose parfois un déménagement ou des déplacements.

Le prélèvement à la source est appliqué au taux neutre tant que l'administration fiscale n'a pas transmis le taux personnalisé : un étudiant rattaché au foyer de ses parents ou peu imposé a intérêt à communiquer son taux réel.

Questions à poser avant de signer le contrat

Le contrat de l'établissement doit préciser plusieurs points qui font varier le net :

• le régime de retraite et de protection sociale appliqué à la rémunération fixe et aux primes ;
• le mode de versement des gardes, par la paie de l'établissement ou par un autre circuit ;
• la localisation du stage et l'éligibilité à la zone d'intervention prioritaire, qui conditionne l'indemnité de 1 000 € ;
• le décompte des 200 actes par mois pour la prime d'activité, et la date de versement de chaque semestre ;
• les prises en charge de transport et d'hébergement, qui ne se cumulent pas avec l'indemnité de zone.

Les maîtres de stage touchent, de leur côté, des honoraires pédagogiques de 600 € brut par mois et par étudiant et, selon les cas, des primes pour l'accueil en zone sous-dotée ; ces sommes ne concernent pas le salaire du docteur junior mais expliquent l'intérêt des cabinets à accueillir ces étudiants.